Лаборатория инновационных лазерных систем создана в 2016 г в результате слияния Лаборатории химических лазеров, Лаборатории применения лазеров и Лаборатории ультракоротких лазерных импульсов, тематику которых она в значительной степени унаследовала. В настоящее время в Лаборатории проводятся исследования спектральных и лазерных характеристик кристаллов A2B6 (ZnSe, ZnS, CdSe, CdS и др), легированных двухвалентными ионами переходных металлов (Cr, Fe и др.), разрабатываются на их основе лазеры среднего ИК диапазона (2-6 мкм) и изучаются возможности их применения в научных и прикладных исследованиях. Разрабатываются способы и устройства для эффективной генерации лазерных импульсов фемтосекундной длительности и исследуются возможности их применения в различных областях науки и техники