История Отдела берет свое начало с февраля 1958г., когда согласно Постановлению Президиума АН СССР в ФИАНе была создана Криогенная лаборатория. Абрам Борисович Фрадков был переведен из ИФП в ФИАН для заведования ею.

В 1964 году был построен отдельный криогенный корпус на территории ФИАН, в котором Отдел располагается в настоящее время.

В начале 1960-х Фрадковым А.Б. совместно с Малковым М.П., Зельдовичем А.Г. и Даниловым И.Б. написан "Cправочник по физико-техническим основам криогеники", в котором отражены основные вопросы физики и техники низких температур. К настоящему времени книга выдержала уже три издания.

В 1970-х годах Отделом, одним из первых в мире, успешно решена задача долговременного хранения жидкого гелия в условиях космического полета.

Отдел состоит из нескольких подразделений:

• Снабжение жидким азотом
• Производство жидкого гелия
• Научно-инженерная часть, состоящая из исследовательской группы и конструкторского бюро

Исследовательская группа ведет работы по изучению магнитных и оптических свойств магнитных соединений с Ян-Теллеровскими ионами, а также многослойных наноструктур на их основе.

Отдел осуществляет проектирование, изготовление и внедрение специализированных криостатов и сверхпроводящих магнитов для научных исследований.

Под руководством заведующего Отделом д.ф.-м. н., профессора Демихова Евгения Ивановича в Отделе ведутся работы по направлению: «Разработка сверхпроводящих магнитно-резонансных томографов». В рамках данных работ в Отделе созданы компактный МР томограф для конечностей и томограф для исследования всего тела с индукцией магнитного поля 1.5 Тл (на фото).